一转眼，就到了四月初一。
娄山关下，刘綎大战杨应龙。关上箭石如雨，人莫敢近。
刘綎原是分了一路绕道后山攻关，杨应龙也派了其手下杨珠偷袭后山夺关，意图对官军形成合围。包围中，都司王芬被流箭射中身亡，守备陈大纲、天全招讨杨愈也战死当场。
正面，刘綎见贼势凶猛，亲率骑兵冲杀，另派了游击周敦吉，守备周以德分两翼夹击，他的家丁及日本降夷用鸟铳、火炮一齐攻打，播军很快就抵挡不住，刘綎一举夺下关隘。
杨应龙反扑了几次，皆失败告终。最后清点战场，斩首26人，俘虏数十人，牛马百十只，军器数百件，刘綎为此战付出的是，阵亡降倭内丁一人，重伤官兵32人，轻伤72人，箭伤倒死马匹19匹，此战可谓大获全胜。
第八路的陈璘因偏沅巡抚都御史江铎抵任视师，表现异常勇猛，在与青蛇囤守军相持半月之后，陈璘分兵前后夹击，前路兵先铳炮齐发，后路也跟着放铳，一时竟打得贼军不知所措，仓皇间匆忙应战，自然很快就败下阵来，余下的人皆逃回囤内。
随后陈璘又命手下再用铜发熕、百子铳、火箭、火砖、喷筒等火器全部招呼上，青蛇囤也并非军事筑垒，显然不堪一击，很快就被攻克。
自此，在播州叛军当中，流传了这么一个传说：合江手硬，綦江铳狠。
几乎与此同时，水西安疆臣亦夺取落蒙关，再取大水田，尽焚桃溪庄。
狡诈如杨应龙，一见形势危急，亲自上囤死守，但同时也向各路军送去投降文书，以延缓官军的攻势。总督李化龙发檄文告诫各路，堤防杨应龙诡降。随后就斩了使者焚了降书。
他深知刘綎与杨应龙关系匪浅，还特地警告他莫要通敌，刘綎为表决心，将使者降书皆送给李化龙处置。
在北面的四路川军中，綦江与合江都是主要进攻线路。合江是第三路人马吴广任总兵，从合江方向发起进攻，三月二十七日开始进攻崖门关（今遵义西北），此关前有闵山屯，有播州军重兵把守。
其实杨应龙的部下几乎没有火器，全是标矢刀枪等，对上刘綎等人的火器阵，优劣立见。所以闵山屯守军很快败退回关……
吴广拿下崖门关后，在水牛塘安营扎寨，又与播军苦战三天，终是击退播军。
杨应龙见递降书无用，又新生一计，他让一众女子现身囤上，带着降书伏地痛哭：“田氏已降……”随后又向吴广谎报杨应龙已死。
吴广留了一个心眼，没有轻信而选择按兵不动，但私下却是派人前去探查消息是否可靠。果然探子回报说：“假的！乃杨应龙的妾室诈降，放出的假消息。实为刘綎的川军攻铁柱关时，火炮射死了杨应龙的手下大将杨珠！并非杨应龙身死。”
吴广一听，气的不轻，万幸他留了一个心眼，没有轻信妇人言。既然已知是诈降，那他也不用再客气。随后吴广再次发起猛攻，烧二关，夺三山，断了播州的柴草和水源。
至此，八路大军中的綦江一路，和其余几路会师于海龙囤下。
从五月十日起，刘綎就开始进攻铁柱关。这是从山脚到山顶的囤前九关之一，后面还有水门关，其间又有里中外三道城墙防御。这种山城防御体系，如果仅用标矢滚木，一时半会很难攻却。
进攻铁柱关时，刘綎特意秀了一把鸟铳射击技术，呆在槽下，用了四门鸟铳换着打，身后有日本亲兵为他轮流上弹药，他只管拿着鸟铳就瞄准射击，贼死无数。
铁柱关的播州叛军拼死反击，在进行最激烈的时候，刘綎手下一日本亲兵，九儿前来禀称，打死一个披银线黑甲的头目，但贼众，难以找级。
刘綎一听就乐了，他猜到那披黑甲头目多半是杨应龙手下大将杨珠，这可是大功一桩，他一人的首级就能抵无数的首级。
“不错！等此战之后，我会亲自为九儿请功！”
在攻克铁柱关之后，刘綎继续出击。因海龙囤四周除了娄山关，还有诸多羽翼之城，有龙爪、望军、海云等囤，亦有养马、养鸡等城，要攻海龙囤必先扫除方可成功。
五月十七，刘綎兵分三路，亲领指挥千把总李朝栋诸人，并各日本降夷，逐处应援。跟着又与南川、永宁两路的官兵汇合，一同追击播军至养马城，继而又攻破险要龙爪、海云囤。
到了五月十八，各路又开始轮番进攻，李化龙又命马孔英率精锐绕后山攻打。杨应龙四面受敌，只是海龙囤倚为天险，飞鸟腾猿不能逾越，而五月的贵州，又开始连日的阴雨，道路变得泥泞，官军整日在泥水里奔波苦战，却始终进展甚微。
自五月十九日起，海龙囤就成了孤城一座，周边要塞全被大军攻占，而且又在杨应龙的老巢外立了无数木栅，将他团团围住。李化龙将大军又分为山前山后五营，每日轮流出兵进攻。
然而恰在此时，李化龙却突然接到家中传来的讣闻……于房中，他手捧书信，一个人呆坐了半天。
不知过了多久，只听他仰天长叹一声，“父亲，恕儿子不孝！”生死决战当头，他根本无法脱身离去。
但尽管如此，他还是起草了檄文，督促各路大军奋力进攻，又想了想，终究是心头难舍亲情，遂上疏乞丁忧。
吏部很快就收到了李化龙的奏疏，只是考虑目前适逢战时，亦奏请朱翊钧，乞从权管事。
朱翊钧也是同样考虑，他采纳了吏部覆议，谕旨道：“军旅大事，正值督兵决胜，当从权移孝，力图报国。待荡平贼巢，处置悉备，方听回籍守制，切勿顷刻杜门，致防机务。”
沈一贯此时正因科臣报黔帅泷澄大捷，而为乞优赏之事上疏万历。贵州巡抚郭子章上疏言镇雄土知府泷澄，斩杨应龙之子杨惟栋，及播州伪官五十余人，贼兵数万。兵科给事中侯先春随后也进言，说应赏赐泷澄，以激励诸路军队。
朱翊钧命下发兵部，覆兵科奏议。沈一贯深思熟虑之后，也跟着上了一疏，疏中言：科臣为黔帅报捷，乞优赏泷澄，系镇雄府土知府，即安尧臣子兄宣慰使安疆臣同母所出安名奉，皇上抚谕泷澄持枪督阵斩获播酋万余，戮其爱子，复诱之，议抚擒送其腹心，尚义等二十四人具见忠义之心，今议赏泷澄金币，臣谨票拟并详始末以闻。
朱翊钧也很快下了旨：泷澄先登敢战，以报朝廷，深可嘉赏。先赏银三十两，大红纻丝二表里，成而之日，还与优叙。仍宣示各汉土官兵，俾其激励，奋威歼贼。
六月初四，天空突然放晴，尽一个月的阴雨绵绵之后，终于重见阳光。
正是难得的好机会，这日，刘綎身着短衣，率领亲兵、降倭数人，各挟鸟铳、杂戎行立城下。城中贼人先还不知，直到箭矢射入城中，才发现原来刘綎率部已至。
“刘总爷来啦！”一声惊慌失措的叫喊，就像滚油中滴入凉水，顿时就炸了锅。
“哗……”众贼轰然奔散。
“砰…砰砰…，”刘綎此时已经不给贼人说话逃跑的机会，数声枪响后，城上贼众被毙多人。随后又一举攻克土城。
这日刘綎亲自来，是为观察敌情，也为明日攻杨应龙老巢做好打算。
而坐困穷崖的杨应龙，已感知到自己的末日即将到来，只是心中还有些许不忿、不甘、不服……
他将亲信叫来，吩咐道：“你去，散银千两也好，万两也好，总之，把敢战之人都给我找来拒敌……我就不信，重赏之下没有勇夫？”
亲兵为难的看着他，但也没多说什么，领命下去。然而杨应龙不知道的是，囤中的苗兵早已骇然四奔，无一人响应他的号召。
五日，以刘綎为主的一路军，开始正面进攻海龙囤，火器有佛郎机、百子铳、鸟铳等，直对着城门齐射。城内的守军早就领教过火器的威力，无一不肝胆俱裂。
眼见城门失守，杨应龙连续组织了三次突围，与他两个儿子亲自带队巡垒，但随后都被猛烈的火力给打退回来。
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杨应龙望着冲天大火，不禁彷徨长叹：“我杨家八百年基业，就此灰飞烟灭！”
转身又见妻妾，亦泣道：“我再也照顾不了你们……”
一声巨响传来，就像专为他杨应龙敲响的丧钟，城门已破，官军就要杀进来。
留给他的时间也不多了，但足以让他选择要如何赴死。
官军在一堆熊熊燃烧的瓦砾中，找到了杨应龙及他妾室的尸身，吴广生擒了其子杨朝栋和杨兆龙。
历时百日之久的播州之役，斩敌二万余人，以杨应龙彻底失败而告终。
很快，朝廷邸报就登了播州一役的战果。早就赋闲在家的前任内阁首辅申时行，见了邸报后，竟连连摇头：“诏发三省财力，又调旁近土司讨之，复添设抚臣，诸如此种，然三省财力耗费以巨亿计，楚蜀之间绎骚甚也！向使委官不索贿，应龙不系狱，调则必赴，召则必来，何至称兵叛逆？挑衅启祸必有任其责者，故好事喜功，穷兵殚财，非国家之利，事可永鉴。”
杨应龙是死了，但身后事却未了尽。