出发之前，阮元也特别找到了苏九妹，和她商量起自己离杭之后的事来。
“九妹，我这次东下台州，再回来的时候，就要直接北上京城了。其实你的事，我也听夫人说了不少，或许……或许让你回临海村，或者另外寻个村子，让你安居，对你来说会更合适一些。”阮元清楚苏九妹心中所想，也主动帮她说了出来：“话说回来，这……这也没什么大不了的，我这些学生，也有不少考上了进士，却不愿做官的，都一样嘛，你也不要多想了。我这里也给你备了二百两银子，无论你回临海村也好，去别的地方落脚也罢，这些钱也够你维持生计了，你想买些田地，或者继续养蚕，都可以，好好把日子过下去吧。你也不要推辞，你的事归根究底，也是我不好，若是当时临海村保甲，我可以提前严办，你们也不会如此啊？”看着阮元言语真挚，不仅主动给自己道歉，还愿意帮自己安居，苏九妹也是感动不已，一时再无言语，俯在一旁泣不成声。
“老爷，我……对不起，您的大恩大德，我……我这辈子，是报答不了的了……”苏九妹哭了半晌，才对阮元抽噎道。
“我何时需要你报恩呢？你或许还不知道，因为你帮着扬州百姓养蚕，现在扬州那些蚕户啊，也都有余钱过日子了，夫人走之前也跟我说，能从你这里学些养蚕之法，她也很开心。这样说来，你就算需要报恩，这恩也算是提前报过了。这钱你只管拿去，以后的日子，还长着呢。”阮元安慰她道。
“老爷……多谢老爷。那……那这场仗打完，老爷您说，我……我五哥他……他能回来吗？”不想苏九妹哭了许久，这时心中却还惦记着孙五。
“你说孙五吗……”阮元看着苏九妹，只觉她面色惨淡，似乎孙五的性命，便和她自己性命息息相关一般，可听孔璐华也杨吉说起孙五，这人根本就不会投降朝廷，若是这一仗打完，多半也就会和蔡牵一道葬身大海了。一时也不忍明言，想了一想，也只好对苏九妹说道；“九妹，若是孙五愿意投降，我们自然会让他返乡归农，若是他不愿意……就要看天命了，海上作战，风涛不定，多有沉船覆舟之险，谁也不能保证这场仗之后，就一定能活下来啊？不过邱军门那边我也熟悉，邱军门从来令行禁止，下属军纪严明，绝不会有滥杀无辜之事，只要在海上能生俘海盗，又或者看到难民，我们一定把他们都救上岸，到时候，保他们性命自是不成问题的。”
“老爷，这……我……”看起来，即便是这样宽和的言语，这时也没法让苏九妹安心。
两日之后，阮元行装收拾已毕，便再一次和杨吉一道，准备东下台州。而阮元自也清楚，这次东下，或许也是他最后一次参与平定海盗之事了。
这日抚院之前，也集中了不少杭州官员和阮元的学生，为首之人，乃是按察使蒋继勋，他之前在金华便与阮元一同办理过严禁溺女之事，这时阮元将杭州事务交托于他，却也放心，杭嘉湖道李赓芸也在一旁，跟阮元商议着钱粮赋税之事，他担任杭嘉湖道时日亦久，这次阮元离任，多半李赓芸也会改任他省，想着李赓芸无论救灾查吏，都帮过自己不少忙，如今却要各奔东西，阮元心中也不觉有些惆怅。
“蒋臬台，近日政务之上，可有不决之处？”阮元也继续向蒋继勋问道。
“嗯……问题倒是没有，不过前日，镇海、慈溪等五个县，把今年的钱粮赋税也都交了上来，今年这还有小半年呢，这些县看起来啊，也确是钱粮充足了。”蒋继勋对阮元道。
“镇海和慈溪？”谁知阮元听着，却出现了一丝疑虑，沉吟半晌之后，阮元对蒋继勋和李赓芸道：“蒋臬台、生甫兄，这些县情况不一样，你们回去之后，一定要查清实情，切莫一概视之，慈溪县我守制之前，便已逐渐完税，这些年又无大灾，钱粮充足，自是官民踊跃之故，是以慈溪知县可赏。但镇海县，长年赋税不能完税，直到去年方才第一次如数上缴钱粮，依镇海县之力，绝无可能半年之内完纳一年钱粮，定是……定是镇海县知县任期已到，急于邀功，是以提前报了全年钱粮上来，如此行径，实是对百姓有害无益！所以你们一定要告知镇海知县，此次急于完税，本是他私心之故，绝不可再加恩赏，而且，定要严斥于他！告诉镇海县，今年绝不可再向百姓征收一分钱粮，若有违制，便即参劾！剩下三个县是哪里，我告诉你们应该如何应对……”张鉴、许宗彦等几个学生，看着阮元将完税五县之事应答如流，共是三县当赏，两县当斥，想着老师对浙江政事了如指掌，一丝不苟，心中都不禁惊叹。
“老师，您治学为政，均是当世楷模，如今一走，学生们以后……以后可要如何是好啊？”张鉴看着阮元与蒋、李二人商议已毕，也对阮元感慨道。各人大多清楚，阮元再次回归杭州之日，也是他正式卸任巡抚，北上面圣请罪之时，到时候反而没有闲暇来和自己道别，是以不少学生，也都将这一次看成了和阮元的诀别。
“春冶，你天赋并不差，别的事对你而言，我想不难。其实无论治学为政，关键都只在一个‘实’字，治学实事求是，为政务要想着实心为民，如此无论学问政事，都可以无往而不利啊。”阮元也对张鉴鼓励道：“老师知道，西夏史一道，你已经研习日久，眼下国朝之内，精于西夏史之人，老师看来也是屈指可数，若你只想潜心治学，便将西夏史继续精研下去，自然可以成一家之言。剩下的，就是日积月累之功了。”后来张鉴果然在西夏史方面有所大成，着成《西夏纪事本末》一书，永传于世。
“老师，您家中之事，内子也都告诉我了，若是刘宜人生产之时需要人手，学生自当相助，老师在台州，也请放心吧。”许宗彦也主动向阮元劝慰道。
“嗯，那也多谢积卿了。”阮元点了点头，看着门前一众学生，便走上前两步，对各人说道：“各位无论来自何处，平日皆能称我一句老师，有此情谊，阮元终生难忘。只是我毕竟人在仕途，四海为官，原无定所，我能够两任浙江巡抚八年，三度为官杭州十一年，本就是可遇而不可求的幸事，十一年前，我离任浙江学政，诸君之中，我记着亦有旧人前来送别，当时只想着此番一去，便不能复见诸君，不想之后，又能两抚浙江，如此恩幸，夫复何求？所以我若是不在杭州了，各位也切莫感伤，若是各位真的愿意与我讲求学问，我自当将日后为官之处，闲居之所，尽数告知大家。到时候，各位若是愿意，就给我来信吧，见信之时，便如亲见各位之面，如此一来，我已是再无遗憾了。今日能得各位相送，阮元待罪之身，不胜惭愧，自当为各位尽礼才是。”说着，阮元也站到学生之前，郑重为各人施了一揖。
“老师恩情，学生永世不忘！”一众学生见阮元诚敬如此，自也纷纷回拜。
很快，阮元便和杨吉一道，东下台州去了，直到八月之初，一行人方才抵达台州，这时，张师诚和邱良功也已经在台州府衙会合，一同请了阮元入府参决军务。阮元看着自己虽已无巡抚之权，却仍然受二人敬重，自也感动不已。
这一日浙江衙署之上，阮元与张师诚、邱良功等人齐聚一堂，一并召开了最后一次战前军议。只是这时阮元想着自己仅是参议军务，巡抚之任早已被停职，便即推了邱良功坐上座，张师诚则在自己右侧为尊，自己甘立左席。邱良功与张师诚本不愿阮元这般谦虚，可见他再三退让，也只好同意了。不过这一日，张师诚身后却意外多了一位年轻人，阮元看他神貌时，只觉这人不过二十五六岁年纪，却是格外成熟稳重，看他仍是布衣打扮，多半便是张师诚新寻的幕僚了，能得到张师诚赏识，可见这位年轻人颇具实才。
眼看自己被推到上位，邱良功也不好再行谦让，便对阮元和张师诚说道：“阮中丞、张中丞，那王乌所供出的情报，末将都给二位中丞看过了，蔡逆这次行动，目标就是浙东无疑，虽说他们或许还有进香普陀之愿，可如此天赐良机，我们不能再失去了。所以我也和王军门商议，只要他在福建打探到蔡牵船队北进，便即出兵，同时，用军务传单告知我等水师，依传单之速，我浙江水师至少可以提前三日整军出海，到时候，就可以在温台海面，与蔡逆正面决战！到时候，我亲率浙江水师在北，王军门也会亲自提领福建水师，在南边海域堵截蔡逆，如此合围，蔡逆必败！”
“是啊，阮中丞，现下我也依你们浙江之法，在福建临时设了军务传单，咱们前后传讯，却要比海寇快多了。眼下方总制到了福建，也为王军门兵船调用了不少内地炮械，这一次，咱们无论炮械、船只，兵力，都是蔡逆数倍不止，这场仗，想来蔡牵便是有通天之能，也逃不出我们的包围了。”张师诚也对阮元说道。
“嗯，我还有一事，想为邱军门提个建议。”阮元始终念及自己戴罪之身，便只以寻常民人身份，向邱良功说道：“邱军门，我等之前所议定的分船隔攻之法，一旦实行，必然需要一只船队紧追蔡逆，一只船队分隔贼船，可这样一来，此役能获头功的，多半便是追击蔡逆主舰的船队，可那只分隔敌船的船队，却多半只能列次功，如此一来，无论谁去分散敌船，都会心怀不满，因为这意味着首功与自己无缘，或许……会影响战意。所以我有个想法，邱军门记功之时，那分兵阻隔敌船的一队，以贼人不能援助蔡牵主舰为功，追击蔡牵的一队，以擒斩蔡牵，又或击沉蔡牵主舰为功，若有功，则同等请赏，不知邱军门意下如何？”阮元也是想着分兵作战，便多半有诸将争功及将士之间相互以为不平之事，是以预先建议邱良功，将两队兵船分别记功请赏，以绝其源。