实验室的白炽灯在众人头顶发出轻微的嗡鸣，叶诗韵带回的焦黑数据芯片在分析台上泛着诡异的幽光。李云谦的手指在全息键盘上飞速敲击，数十道数据流在空气中交织成网，可每当他试图解析芯片内的信息，那些字符就如同流沙般溃散重组。
“这不是常规的加密技术。”李云谦扯下防护面罩，额角渗出细密的汗珠，“数据里掺杂着生物电波频率，就像......有人把意识编码进了这些二进制代码。”他调出之前金属圆片的分析报告，两组数据的波动曲线竟呈现出镜像般的共振。
顾梦突然将培育室培育的荧光藤蔓贴在芯片表面，原本蔫软的藤蔓突然剧烈震颤，叶片上浮现出与芯片相同的纹路。“这些植物对‘永夜机械会’的能量频率有反应！”她的声音带着兴奋，“在基地时，它们就和机械装置产生过共鸣，或许这就是破解数据的关键！”
露娜却突然按住操作台，所有屏幕瞬间转为红色警报。实验室外的防护穹顶泛起涟漪状的能量波动，如同被投入石子的湖面。“有隐形舰船正在穿透防护罩，数量至少五艘！”她放大监控画面，只见虚空中隐约浮现出齿轮状的舰船轮廓，正是“永夜机械会”的标志。
叶诗韵立刻冲向武器库，却发现存放新型磁暴手雷的保险柜自动弹开，里面只剩一张齿轮形状的金属卡片，上面刻着猩红的倒计时：00:05:00。“不好！他们早就渗透进来了！”她的激光手枪还未举起，实验室的重力系统突然紊乱，所有人被甩向天花板。
李云谦抓住悬浮在空中的操作台，瞥见通风管道闪过黑影。他迅速发射追踪器，却见追踪器在接触黑影的瞬间爆成火花。“是纳米拟态机器人！”他大喊道，“它们能模拟任何物质形态，小心身边的——”话未说完，身旁的顾梦突然双眼翻白，脖颈处浮现出齿轮状的机械纹路。
“顾梦！”露娜甩出电磁束缚网，却被顾梦徒手撕碎。此刻的顾梦行动僵硬，皮肤下隐约可见金属零件在蠕动，她举起手中的藤蔓，植物瞬间化作尖锐的骨刺，直刺露娜咽喉。千钧一发之际，叶诗韵用激光手枪打断骨刺，却发现藤蔓断口处流出的不是汁液，而是黑色的机油。
“她被机械同化了！”工程师扯下防护服内衬，将特殊导电纤维缠绕在顾梦身上，“这种同化需要能量传输，切断她与外界的电磁联系！”随着电流滋滋作响，顾梦眼中的机械光芒渐渐消散，瘫倒在地前，她虚弱地呢喃：“有...有东西在我脑子里，他们...在监听所有计划......”
露娜的通讯器突然自动启动，线人的声音再次响起，却不再急促慌张，反而带着冰冷的笑意：“恭喜你们，成功激活了第二阶段实验品。那个所谓的‘秘密基地’，不过是我们随手丢弃的诱饵，现在，该让你们看看真正的——”画面亮起，竟是实验室的实时监控视角，众人惊恐地发现，整个实验室的墙壁都在渗出黑色黏液，逐渐凝结成巨大的齿轮形态。
“这是‘永夜机械会’的新型纳米集群！”李云谦将顾梦转移到急救舱，双手在分析台上疯狂操作，“它们能吞噬任何物质，把整个空间改造成他们的战争兵器！我们必须在齿轮完全成型前找到核心控制器！”
叶诗韵踹开变形的舱门，发现走廊里的机械守卫正在自毁重组，残骸拼凑成巨大的齿轮状怪物。她甩出链刃缠住怪物关节，却见链刃接触的瞬间被同化腐蚀。“这些东西根本打不完！”她边退边射击，激光在怪物身上激起阵阵火花，却只能延缓它的行动。
工程师突然指着天花板的通风口：“看！黏液的流动方向都指向能源核心！控制器一定在那里！”话音未落，整个实验室剧烈震颤，众人被一股无形的力量吸向天花板。露娜抓住墙上凸起的管道，将电磁脉冲弹投向黏液汇聚处，爆炸的强光中，隐约可见一个人形轮廓悬浮在齿轮核心。
“那是...线人？！”叶诗韵目瞪口呆。只见线人全身覆盖着机械外骨骼，背后展开巨大的齿轮状羽翼，手中握着与金属圆片同款的装置。他张开机械下颌，声音通过整个实验室的扩音器回荡：“星火方舟的蠢货们，你们以为能破解我们的计划？从你们捡起第一枚金属圆片开始，就已经是实验的一部分了！”
李云谦突然想起什么，冲向存放金属圆片的保险柜。圆片表面的纹路正在变化，拼凑成一个完整的齿轮图案，同时释放出强烈的能量波动。“不好！这是激活装置！他们要把实验室变成第二个‘永夜熔炉’！”他调出星火方舟的应急预案，却发现所有逃生通道都被纳米黏液封锁。
露娜将最后一枚干扰器插入地面：“我可以暂时冻结黏液，但只有三分钟！叶诗韵，你带大家去备用逃生舱；李云谦，想办法关闭核心控制器！”她的干扰器散发出蓝光，周围的黑色黏液如同被按下暂停键。叶诗韵扛起昏迷的顾梦，带着工程师冲向走廊尽头，而李云谦则逆着人流，朝着齿轮核心的方向狂奔。
当李云谦接近核心时，线人突然出现在他面前。机械羽翼掀起的气浪将他掀翻在地，线人举起手中装置，对准他的胸口：“你以为自己能改变什么？‘永夜机械会’的计划早已渗透进星际联盟的每一个角落。这个实验室，不过是我们用来测试新型同化技术的培养皿罢了。”
李云谦的指尖悄悄触碰到腰间的神经震荡器，这是他秘密研发的反机械武器。“你们错了。”他突然暴起，震荡器刺向线人的机械心脏，“真正的实验品，是你们这些自以为掌控一切的疯子！”震荡器释放出的高频脉冲让线人浑身抽搐，手中的装置也脱手而出。
与此同时，叶诗韵等人在逃生舱外遭遇最后一波机械守卫。工程师将自制的Emp炸弹扔进守卫群中，爆炸的瞬间，众人趁机冲进逃生舱。叶诗韵启动发射程序，却发现逃生舱被某种力量锁定。她转头望向实验室方向，只见李云谦正抱着装置从齿轮核心纵身跃下，在空中引爆了所有剩余的磁暴手雷。
剧烈的爆炸将纳米黏液炸成漫天碎片，实验室的防护罩在能量冲击下支离破碎。叶诗韵的逃生舱在气浪中翻滚，透过舷窗，她看到李云谦的身影在火光中若隐若现，而那个线人，早已消失在爆炸的核心。
当逃生舱降落在附近的小行星时，露娜检测到实验室方向的能量波动正在减弱。顾梦也悠悠转醒，摸了摸脖颈处残留的机械纹路：“我...我好像做了个很长的噩梦。”叶诗韵望向星空，那里还残留着爆炸产生的绚丽星云，如同给这场惊心动魄的战斗画上了注脚。
“这不是结束。”李云谦的声音突然从通讯器传来，众人惊喜地发现，他不知何时登上了另一艘备用飞船，“我从核心装置里提取到了关键数据，‘永夜机械会’的阴谋，远比我们想象的更加庞大。”他的身后，全息屏幕上显示出密密麻麻的坐标，每一个光点，都代表着一个潜在的危机。
在遥远的宇宙深处，巨大的齿轮虚影缓缓转动，新的挑战，才刚刚开始......