华盛顿，白宫战情室
气氛前所未有的紧张。富兰克林·d·罗斯福总统面色凝重地坐在轮椅上，他的面前坐着陆军参谋长乔治·马歇尔将军、曼哈顿工程军方负责人莱斯利·格罗夫斯上校、西部财团代表特纳·史密斯和杜邦公司总裁皮埃尔·杜邦，以及几位核心内阁成员。桌上摊着一份由橡树岭和洛斯阿拉莫斯实验室上百名顶尖科学家联名签署的抗议信，信中措辞激烈，威胁若不停止对奥本海默的“非法监视”并保障学术自由，他们将集体罢工。
“先生们，”罗斯福的声音带着疲惫和一丝罕见的懊恼，“我们遇到了大麻烦。我们最宝贵的资产——那些从欧洲逃离纳粹迫害、为我们研制‘终极武器’的头脑们——现在要造反了。原因是我们自己人的愚蠢行动！胡佛局长对奥本海默博士的秘密调查，被他们视为对美国核心价值观——自由与平等的背叛。他们将其与盖世太保相提并论！罢工的威胁是真实的，项目一旦停滞，损失将不可估量！”
特纳·史密斯首先开口，他的语气冷静却带着尖锐的批评：“总统先生，请允许我直言。将心比心，如果您是一位项目负责人，在承担着国家最高机密任务的同时，却要时刻担心背后有一双来自上级部门的、不信任的眼睛在盯着你，甚至干涉你的私生活，您会作何感想？这些科学家，许多人是冒着生命危险从希特勒的魔爪下逃到美国的。他们选择美国，是因为这里象征着‘自由之地’。现在，胡佛局长的做法，让他们嗅到了曾经在德国熟悉的那种恐怖气息。他们害怕了！他们怕自己呕心沥血的研究成果，最终会变成迫害自己的工具！中国有句古话，‘狡兔死，走狗烹’。他们怕自己就是那些‘走狗’！”
罗斯福深深地吸了一口气，特纳的话击中了他的要害。他意识到，这次事件不仅仅是管理失误，更是严重的政治和信任危机。他缓缓说道：“我明白了…这是我的失误。我们对安全问题的处理方式过于粗暴，伤害了这些宝贵人才的信任。这个错误，我必须承认。”
他转向格罗夫斯上校，果断下达指令：“格罗夫斯上校，请你立刻亲自飞往洛斯阿拉莫斯，以我的名义，向奥本海默博士和全体科研团队做出最正式、最明确的保证：第一，联邦调查局对奥本海默博士的所有秘密调查立即无条件终止！第二，我以总统的信誉担保，曼哈顿工程将绝对尊重每一位科学家的学术自由和个人隐私，安全审查将严格遵循法律程序，绝不会再出现类似的无端猜疑和秘密监控！告诉他们，美国依然是，也永远会是他们可以安心工作的自由国度！”
“是，总统先生！”格罗夫斯立正领命，他深知此行责任重大。
这时，皮埃尔·杜邦补充道，他的角度更为务实：“总统先生，格罗夫斯上校的保证至关重要。但我们也必须正视真正的问题所在。这些顶尖科学家，他们的心思全在实验室里，他们搞间谍活动的可能性微乎其微。真正的风险点，在于他们身边的人——配偶、情人、助手、社交圈里的各色人等。这些人更容易被苏联的情报机构盯上和策反。胡佛局长把主要精力放在奥本海默本人身上，完全是本末倒置，不仅徒劳无功，还引发了灾难性的后果。安全工作的重点，应该放在外围筛查和背景监控上，而不是去骚扰项目的核心灵魂。”
乔治·马歇尔将军的脸色一直非常难看，此时他忍不住插话，语气带着军人的直率和对资源浪费的痛心：“总统先生，杜邦先生说得完全正确！胡佛局长这次鲁莽的行动，不仅险些造成我们最核心科研团队的崩溃，更直接导致了项目进度可能的延误！为了平息这件事，我们需要投入额外的政治资源和时间成本，这变相消耗了数百万美元的纳税人经费！这是一种严重的渎职行为！必须对胡佛局长提出最严厉的斥责，并要求他彻底整改反间谍工作的方向和方法！”
罗斯福点了点头，对马歇尔的意见表示同意：“乔治，你说得对。浪费资源、动摇军心，这是不可接受的。我会亲自召见胡佛局长，明确指出他的错误。国家安全不等于疑神疑鬼，更不等于可以肆意践踏法律和信任。曼哈顿工程的安保工作，必须由格罗夫斯上校的统一领导下，与联邦调查局进行更明确、更理性的分工协作。胡佛的人，只负责对外围情报的收集和分析，绝不允许再直接触碰核心科学家！”
会议结束后，格罗夫斯立即动身前往洛斯阿拉莫斯。他面对群情激愤的科学家们，坦诚地传达了总统的歉意和保证。奥本海默在得知调查停止、并且总统亲自出面担保后，情绪逐渐平复。科学家们看到最高层的诚意，也暂时收回了罢工的威胁，但一双双眼睛将继续警惕地注视着任何可能的风吹草动。
而在胡佛的办公室里，他接到了总统措辞严厉的电话。他阴沉着脸听完训斥，心中充满了屈辱和愤怒，但他明白，这次他触碰了不可动摇的红线。他不得不暂时收敛，将曼哈顿工程的调查权限拱手让给格罗夫斯，并将更多精力转向其他“更安全”的目标。然而，他对奥本海默和这些“不听话”的科学家的怀疑和敌意，却更深地埋藏在了心底。
这场风波，以罗斯福政府的退让和道歉告终。它深刻地提醒了美国的高层：在争夺世界最顶尖人才的战争中，除了提供优厚的物质条件，维护一个开放、自由、可信赖的环境，同样是至关重要的战略资源。对科学家的尊重与信任，是驱动曼哈顿工程这艘巨轮前行的、比铀矿石更加珍贵的燃料。
新墨西哥州，洛斯阿拉莫斯实验室临时指挥部
一间简陋但挤满了人的木屋里，气氛凝重而压抑。来自橡树岭和洛斯阿拉莫斯的主要科学家代表——恩里科·费米、利奥·西拉德、理查德·费曼等人都聚集在此，他们脸上带着愤怒、焦虑和一丝决绝，等待着格罗夫斯上校的到来，准备进行最后的摊牌。
莱斯利·格罗夫斯上校大步走进房间，他表情严肃，但眼神中已经没有了之前的强硬，取而代之的是一种经过权衡后的务实。他没有绕任何圈子，直接站在众人面前，声音洪亮而清晰：
“先生们！我刚刚从华盛顿回来，带回了富兰克林·d·罗斯福总统先生的最新指示，也是他对曼哈顿工程全体科研人员的郑重承诺！”
房间里瞬间安静下来，所有目光都聚焦在格罗夫斯身上，空气中充满了紧张的期待。
格罗夫斯环视众人，一字一顿地宣布：“总统先生指示：第一，针对罗伯特·奥本海默博士的所有不当秘密调查，立即、无条件、永久性地终止！第二，总统以他的名誉和职位担保，在曼哈顿计划的整个研发期间，每一位科学家的学术自由和个人尊严都将得到最高程度的尊重和保护！任何安全审查都必须严格遵循法律，绝不会再出现无端猜疑和非法监控！美国，永远是各位可以安心追求科学真理的自由之地！”
话音刚落，死寂般的沉默被瞬间打破！
“太好了！”
“我们赢了！”
“上帝保佑美国！”
“这才是我们认识的美国！”
房间里爆发出热烈的欢呼声、掌声和如释重负的感叹声。连日来的阴霾和愤怒一扫而空，科学家们的脸上重新绽放出光彩和斗志。
恩里科·费米这位一向沉稳的意大利物理学家，用力地拍了拍身旁助手的肩膀，脸上露出欣慰而感慨的表情，用带着浓重口音的英语对助手说：“你看，乔凡尼，这就是罗斯福与希特勒的本质区别。独裁者从不认错，他们只会用更大的错误掩盖前一个错误。而真正的领袖，懂得在意识到错误时，有勇气承认并改正。这小小的不同，却决定了自由与奴役的天壤之别。”
利奥·西拉德则激动地搓着手，对旁边的同事说：“感谢上帝！罗伯特（奥本海默）终于可以摆脱那些该死的纠缠，全身心回来了！天知道，没有他在这里协调理论组的工作，整个链式反应的理论模型都快乱成一锅粥了！我有一大堆关于中子通量计算的问题等着和他讨论呢！” 他的语气中充满了对项目进度的关切和对奥本海默能力的依赖。
年轻气盛的理查德·费曼则用他标志性的、带着戏谑和自信的口吻大声说道：“嘿！我就说过！就算是FbI那帮家伙，也别想耽误我们造原子弹的进度！在伟大的科学面前，一切官僚作风都是纸老虎！”他的话引起了一阵会心的大笑，气氛变得更加轻松。
格罗夫斯看着眼前这群重新焕发活力的科学家，心中也松了一口气。他知道，总统的果断让步挽救了项目。他抬起手，示意大家安静：
“先生们！总统的承诺已经给出。现在，轮到我们兑现我们的承诺了！德国人可能正在加紧他们的铀计划，时间不等人！我希望大家能把所有的精力，立刻投入到工作中去！让我们的‘ gadget’（当时对原子弹的隐晦称呼）早日诞生！用我们的成功，来回报这份来之不易的信任和自由！”
“放心吧，上校！”
“我们这就回实验室！”
“让德国佬和所有怀疑我们的人见识见识！”
科学家们士气高昂地纷纷散去，迫不及待地返回各自的岗位。奥本海默在得知消息后，长久以来的心理压力也得到了极大的缓解，他更加专注地投入到工作中。
这场风波以罗斯福政府的退让和科学家的胜利告终。它深刻地表明：在关乎国家命运的最高科技竞争中，赢得顶尖人才的心，与他们赢得科学突破同样重要。罗斯福的政治灵活性，成功地化解了一场潜在的灾难，将这群个性鲜明、思想独立的科学天才重新凝聚在了曼哈顿工程的旗帜下。而“自由”与“信任”，作为美国与极权国家竞争中最有力的武器之一，在此刻显现出了它无形的、却至关重要的价值。