朱慈烺颁布旨意，对文化殿与武英殿进行重新修缮，以此作为内阁与军机处的办公场所，自此，大明的军令与政令皆由此处传向全国。
坐落于奉天殿左侧的武英殿，配备了凝道殿与焕章殿这两个东西配殿，左右廊房共计六十三间，现今已转变为军机处的办公地点。
各位军机大臣及军机参赞均享有独立的书房以处理公务，此外，还设有膳食堂与休息室，而主殿则作为朱慈烺的办公地点及会议室。
朱慈烺总觉得置身高处、一群人于下方站立议事的模式颇为别扭，故而采用后世会议室的布局方式进行设计。
在即位前，便责令御用监打造两张长方形会议桌以及配套的椅子，作为大明最高的行政机构，自然不可显得简陋。
恰巧御用监尚存有一批顶级木材原料，这些木材是当年原定于运往北京城，献给天启帝的，还没开始运输，天启帝便驾崩了，于是闲置在南京御用监。
朱慈烺即刻批准将其投入使用，并拨足了所需银两，御用监加班加点地工作，分别制作出一张金丝楠木与黄花梨木的大长桌。
这两张桌子做工精致细腻，细节之处雕刻得栩栩如生，楠木桌放置于武英殿，而黄花梨木桌则安置在文华殿。
武英殿上由朱慈烺所写的“武德昭彰”四个大字，军机处众人议事之时，皇帝坐于中间，众臣按照级别分坐两侧。
武英殿上方悬挂着由朱慈烺亲笔题写的“武德昭彰”四个大字，气势恢宏，此外，还设立了秘书司，全权负责武英殿的各项后勤管理工作。
而内阁所在的右侧文华殿也做了相同的配置，文华殿会议室的匾额上则是方岳贡题写的“文渊洽熙”四个大字。
对于朱慈烺这样安排，也没人有异议，这些天来众臣逐渐熟悉了这位大明新君的脾气秉性。
皇帝似乎很不习惯自己坐着而别人站着议事的场景，因此在议事时，总是会赐予众人座位。
朱慈烺之所以做出这些改变，就是要彻底改变朝廷原本的朝会制度，换成更为高效的方式来处理朝政。
原本的朝会，分为大朝会、朔望朝和常朝，大朝会为礼仪性朝会，正旦、冬至和皇帝生日举行，或者皇帝登基、大婚、册封皇后、太子时在奉天殿举行。
朔望朝同样是礼节性朝会，每月初一、十五举行，百官公服在奉天殿向皇帝行礼，同样不处理具体政务。
朝廷政务都是在常朝时处理，分为早朝和午朝，早朝在奉天门前举行，也就是所谓的御门听政，这是讨论全国政务的核心会议。
早朝官员所奏之事，一般都长篇大论，滔滔不绝，午朝则是作为早朝的补充，主要作为早朝的补充，主要探讨全国的军情要务，所奏之事，要简洁明了一些。
朱慈烺登基之后，首要变革之一便是推行七天工作制，古代中国早有七曜之概念，而此时欧洲的七天周期观念也已广为流传，并随着天主教的传入进入中国。
朱慈烺未采用西方的说法，而是以古代七曜为基础，制定了每七天为一个周期的工作制度，前五天为工作日，后两天则用于休沐，此制度自中央开始推行。
常朝于每周一、三、五举行三次，所有在京官员均可参加，地点改至奉天殿，时间则定于辰时开始，午时结束。
原本的早朝需官员于寅时起床，经过半天的折腾，即便皇帝也常常疲惫不堪，精力消耗巨大，且效率不高。
并非人人都能如太祖和崇祯般坚持，因此这是朱慈烺登基之后，迫切改革的一项，天还没亮就被叫醒的感觉太难受了。
在京各部官员，只要达到相应级别均可参加常朝，主要议程为各部汇报工作情况及提出建议，众官员共同讨论。
涉及军国大事的决策则由内阁和军机处内部商议，不再公开讨论，这样避免各官员相互的攻击扯皮，还能做到保密。
正常情况下，各部门官员，从大到小皆每天辰时上班，戌时下班，中午休息半个时辰，并建立了请假考勤制度。
皇帝也不例外，无特殊情况，必须在内阁或者军机处值班，批阅内阁呈上来的奏疏，有异议的地方，便直接可以开会讨论。
制定好朝廷的工作制度之后，朱慈烺直接将官员原本的待遇提高了三倍，并且取消粮食发放，直接发银子。
因为大明官员的工资实在是太低，以至于贪墨都成为了朝廷惯例，因此不如直接提高官员的待遇。
接下来要做的事情太多了，但有些迫在眉睫的问题，现在必须要解决，那便是西南四川的问题。
五月十五日，内阁第一次扩大会议便在文化殿召开，因为涉及军事方面，所以军机处几位军机大臣也悉数到场。
此次会议的主题便是应对四川的计划，根据西边传来的军报，清军在击败李自成之后，便放弃了武昌，撤到长江以北。
而李自成率领顺军残部也逃到九宫山附近，消失的无影无踪，若是进军四川，必须接管武昌等地，还要找到李自成。
根据原本历史上的记载，李自成会死在九宫山，这个时空发生了那么多变故，现在李自成死没死，朱慈烺也不能确定了。
内阁一部分成员认为，一直认为必须优先消灭流窜于湖光的李自成残部，一是为崇祯帝复仇，二生怕他会东山再起，卷土重来，威胁南京的安全。
堵胤锡却认为，必须尽快进军四川，一旦张献忠占据四川，从而养精蓄锐，对大明的威胁更大。
朱慈烺也同意堵胤锡的意见，他知道除了李自成残部，顺军还有李过和高一功率领的一路主力。
若是对李自成赶尽杀绝，势必会影响其它地区，新朝虽然建立，但此刻大明年仅仅对山东、江南地区控制的牢固，免生其它祸端。
经过讨论之后，内阁决定了向四川出兵的计划，同时派人前往湖广，想办法对李自成进行招抚。
大明现在的可战精锐，只有不到十万人，还得防备清廷，因此最多只能派遣一个军团前往四川。