当最后一名在忠烈祠前因“通敌”罪名而被当场下令斩首的官员尸身被拖走，当京师内外因为皇帝的雷霆手段而陷入一片死寂般的“平静”时，崇祯皇帝独自一人坐在东暖阁内，心中却并无多少胜利的快意，反而是一种深刻的、对这个时代、对这个体制的反思。
他知道，外面的人，尤其是那些幸存的、或是远在江南的士大夫们，此刻定然在心中将他骂作了“桀纣”、“暴君”。他们会将这场由他主导的、几乎将东林党连根拔起的清洗，定性为又一次残酷的党争，是“帝党”对“清流”的无情打压。
“党争？” 崇祯嘴角露出一丝冷笑，“他们错了。这从来就不是什么简单的‘东林’与‘帝党’之争，而是……皇权与整个士人官僚集团之间，一场持续了数百年、根本无法调和的权力争夺！”
他想起了大明历史上那场着名的、几乎贯穿了万历皇帝中后期的“国本之争”。万历皇帝朱翊钧，宠爱郑贵妃及其子福王朱常洵，一心想废长立幼，改立福王为太子。然而，就是这个看似属于皇帝“家事”的决定，却遭到了以东林党为首的文官集团长达数十年的、极其激烈的反对！他们高举着“祖宗成法”、“宗法礼教”的大旗，以“国本”为名，不断上疏、廷争、甚至不惜罢官、廷杖，硬生生将万历皇帝立储的意愿，彻底粉碎！最终，万历皇帝心灰意冷，选择了长期的消极怠政，而那个他并不喜欢的皇长子朱常洛，则在文官集团的“拥护”下，最终得以继位。
“在那些东林君子看来，这或许是他们以道德和祖制‘匡扶’君上、维护‘正统’的伟大胜利。” 崇祯心中暗道，“但在朕看来，这却是皇权在士大夫集团面前一次可耻的屈服！是君权旁落、文官坐大的铁证！正是从那时起，文官集团愈发骄横，视皇权如无物，党同伐异，把持朝政，最终将大明一步步推向了深渊！”
“朕，绝不会重蹈万历的覆辙！” 他眼中闪过一丝厉色，“朕不在乎后世史书如何评价！朕不在乎什么‘清流’的唾骂！朕只要权力！只有将权力牢牢掌握在自己手中，朕才能推行改革，才能挽救危局！至于那些胆敢阻碍朕、挑战朕权威的……无论是谁，无论是哪个派别，朕都会毫不犹豫地将其碾碎！如今的东林党，在朕的铁腕清洗之下，早已失去了任何实质性的反抗能力！”
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为了彻底巩固清洗的成果，并震慑潜在的反对者，崇祯皇帝的手段还在继续。
他以“贪腐渎职”、“抗旨不遵”等各种名义，将那些在近期动荡中立场不明、或是与东林党有牵连的京官，成批地罢黜、下狱、甚至流放！短短时间内，朝堂之上，几乎为之一空！
对于那个象征着士林精神领袖地位的曲阜孔府，崇祯也并未忘记。他以“查验祭田账目、整顿地方吏治”为名，直接下令新任山东总兵牟文绶，派兵将整个孔府严密“保护”起来！名为保护，实为监控！并勒令衍圣公闭门思过，不得干预地方事务！这无异于是向天下所有士人宣告：即便是圣人之后，若敢与朝廷作对，也绝无情面可讲！
同时，对于那些被捕入狱的官员和士子，崇祯更是下令厂卫，采取“瓜蔓抄”的方式，深挖其背后的关系网，务求将所有同党、门生、故吏一网打尽！他要用这种方式，彻底摧毁东林党及其附庸势力在朝野上下盘根错节的网络，为自己信任的人，腾出位置。
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而空出来的位置，由谁来填补？
崇祯的目光，落在了太子朱慈烺的身上。这个孩子，是历史上的崇祯皇帝的长子，也是名义上的储君。然而，在他的记忆中，这位太子自小便接受的是最为正统的儒家教育，身边的老师、侍从，大多都与东林党有着千丝万缕的联系。如今，自己与东林党已是水火不容，这个被“敌人”培养起来的太子，将来……真的能够继承自己的“事业”吗？他能理解并支持自己这些“离经叛道”的改革吗？崇祯心中充满了疑虑和淡漠。
恰在此时，皇后周氏有孕的消息，如同上天赐予的甘霖，让他看到了另一种可能！“若……若冉儿能为朕诞下一位皇子……” 他心中那个大胆的念头再次浮现，“一个由朕亲自教导、能够完全理解并继承朕之意志的皇子！或许……这才是大明未来的希望所在？” 废长立幼？另立储君？这个在历史上曾引发巨大风波的念头，此刻，竟真切地出现在了他的脑海之中！
这种对现有储君的不信任，以及对未来新继承人的期盼，也直接影响了他当前的用人策略。
他公开在朝堂上表示：“朕今后用人，唯才是举，唯忠是取！不再拘泥于什么‘清流’、‘浊流’之分！那些满口仁义道德、实则空谈误国之辈，朕敬而远之！反倒是那些能办事、敢办事的‘干吏’，哪怕出身不高，哪怕曾有过错，只要真心归附于朕，忠心为国，朕皆可破格重用！”
他甚至暗示，可以重新启用那些在过去被打压的、非东林派系的官员，无论是浙党、齐党、楚党，甚至……是那些在天启年间曾依附过魏忠贤、如今却愿意向自己效忠的“旧日宦党”！
“总而言之一句话！” 他的声音斩钉截铁，“在这朝堂之上，只有忠于朕、能为朕办事的人，才能得到重用！至于派系……朕不看！朕要的，是一个绝对服从、高效运转、唯朕马首是瞻的中央集权之朝堂！在这朝堂之上，只有皇家说的话，才真正作数！”
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崇祯这番近乎“离经叛道”的言论和用人标准，自然再次引来了宫中某些人的担忧。懿安太后张嫣（天启皇后），这位在后宫中仅存的、辈分最高的前朝遗孀，在听闻皇帝近期的种种酷烈手段，尤其是诛连九族、夷平十族、甚至要重用“阉党”之后，终于忍不住，亲自来到暖阁，试图劝阻。
“陛下，” 张嫣的语气带着几分哀婉和忧虑，“哀家知道您为国事操劳，心中愤懑。然则，杀戮过甚，株连过广，恐伤天和，更失民心啊！自古帝王治国，当以仁德为本。还请陛下……稍息雷霆之怒，三思而行，莫要……莫要扩大打击面，以免动摇国本啊！”
然而，面对这位皇嫂的苦心劝谏，崇祯却只是冷冷一笑，毫不客气地反驳道：“皇嫂！您是真忘了，还是在装糊涂？！” 他直接搬出了晚明三大疑案：“当年的‘梃击案’，是谁在背后指使，欲置先帝（指万历的皇长子，泰昌帝朱常洛）于死地？！‘红丸案’，又是谁进献丹药，致使先帝（泰昌帝）暴毙？！‘移宫案’，又是谁把持后宫，挟持先帝（指天启）幼子，意图不轨？！这些案子背后，哪一件没有东林党人搬弄是非、兴风作浪的影子？！”
“他们所谓的‘清流’，不过是沽名钓誉、党同伐异的遮羞布罢了！他们对先帝不忠！对朕不敬！如今更是暗通外敌（指陈名夏案），图谋不轨！此等乱臣贼子，不将其连根拔起，彻底清除，难道还留着他们继续祸乱朝纲吗？！”
“朕意已决！” 崇祯的声音斩钉截铁，“清算，必须进行到底！绝不姑息！也请皇嫂放心，” 他的语气中带着一种不容置疑的自信，甚至可以说是……霸气，“这天下，是我朱家的天下！朕绝不会让它，断送在这些伪君子手中！”
面对崇祯这番充满了愤怒、自信、甚至带着几分偏执的强势回应，看着他那双因连番胜利（良乡、宣府、辽东、澳门……）而充满了慑人光芒的眼睛，懿安太后张嫣，最终选择了沉默。她张了张嘴，似乎还想说什么，但最终，只是化作一声幽幽的叹息。或许……或许这位行事酷烈、与历代先帝都截然不同的年轻皇帝，真的……能创造奇迹？真的……能拯救这风雨飘摇的大明？她不知道，也不敢再反对了。
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崇祯知道，自己的强硬和铁腕，必然会引来无数的非议和历史的“骂名”。但他不在乎。他只知道，若没有这番彻底的内部清洗和权力的高度集中，就不可能有近期军事上的一系列转机：御驾亲征鼓舞士气，歼灭刘芳亮南路流寇主力十余万；启用陈奇瑜、董琦等人，收复固关、保定、真定、顺德等失地；高杰阵斩鞑虏亲王阿巴泰，扬我国威；周遇吉坚守宁武，迫使李自成主力西撤……
这一系列的胜利，虽然代价沉重，虽然并未彻底消灭敌人，但却实实在在地扭转了之前的颓势，为大明王朝，争取到了宝贵的喘息之机，也展现出了一丝皇权中兴的希望之光！而这一切，都更加坚定了他必须将这条铁血之路，走到底的决心！