故事开头，漆黑的宇宙中出现许多圆盘飞船，这被科特队部署在太空上的卫星发现，这段时间他们遇见了太多的外星人，所以科特队发现后通过卫星与圆盘飞船沟通，但结果却并没有回应。
秉承着守护蓝星的信念，科特队下令攻击，最终消灭了大部分的圆盘飞船，只余下一艘逃进了蓝星。
结果存活下来的这艘飞船，里面却有着奥特曼剧中最强大的怪兽，宇宙恐龙杰顿。
通过这艘存活下来的圆盘飞船，杰顿星人偷偷潜入了科特队本部，趁机摧毁了科特队的本部大楼。
杰顿星人之后在逃跑途中，被皮特发现了踪迹，给拦了下来，双方在争斗过程中，皮特一拳将杰顿星人的原型给打了出来。
看着现出原形杰顿星人，电视机前的观众都发现他和童年一部动画片中的一个角色好像！
是你吗，痞老板！
一旁的田进看见岩本博士居然是杰顿星人伪装的，直接一枪打在了痞老板的眼睛上，面对这个威力强大的激光枪，痞老板惨叫着化为了虚无。
不过临死前杰顿星人也是召唤出了圆盘飞船内的宇宙恐龙杰顿。
“芝顿！”
田进几人戒备的看着从圆盘飞船内部出现的宇宙恐龙杰顿，听着他那恐怖的叫声，几人都知道这是一个劲敌。
赵城将tV剧中的杰顿造型给改了一下，不让其在那么臃肿，毕竟原剧的皮套设计时间太过久远，造型在现在看来实在是没有恐怖感。
他在设计方面参考了超级芝顿的样子，但又没有完全照抄，也就是外甲设计的更加有生物感，身材更加纤细一点。
因为超级芝顿还要在未来迎战赛迦，可不能现在就暴露出去。
宇宙恐龙在出现后，它谨记杰顿星人的命令，彻底消灭蓝星的抵抗力量，也就是国际警察署，科特队的上级部门，所以杰顿星人在看见不远处冒着火光的科特队总部大楼时，顿时就直冲冲的向着远处的大楼走去。
“一定要截住它，不能让他进入本部！”
队长严松敏向着科特队还保存着战力的几人说道。
“是！”三人对视一眼，顿时拿着枪朝前方冲去。
就在这时，天空也传来呼啸。
“是科特队其他分部的弟兄！”
严松敏看见这一幕，顿时兴奋的喊道：“我们上，一起消灭这个家伙！”
与此同时，总部大楼中，高层在急忙发布疏散命令，杰顿这么庞大的一个怪兽向着本部走来，他们当然得赶快撤离。
科特队的小成员鹿野此时帮忙疏散着大楼里的人员。
作为整个蓝星的武装力量总部，这栋大楼里当然不只有战斗人员，还有数万的后勤人员。
这些其实是原剧中没有表现出来的，原剧中杰顿出现时，整部剧就只有不到五个人类出现在镜头前，本来一副世界末日的景象，但硬生生给演成了过家家。
赵城的重置版既然特效建模都花大价钱去升级了，那么这些小细节当然不会放过。
就比如说当初在拍杰顿这场戏时，他是真的找了几千个群演，来演这场本部大楼内大撤退的场景。
宇宙恐龙杰顿看着楼内的人员正在迅速撤离，等他接近大楼的时候，恐怕楼内也就不剩下几个人了，想到这里的杰顿，顿时停下脚步，开始在胸前汇聚能量。
严松敏看着停下脚步的杰顿，还以为他们的阻击起了作用。
“不好，杰顿是在施展攻击！”田进看着这一幕却脸色一变，连忙向大楼后方跑去。
大楼内的小队员鹿野正搀扶着被杰顿星人袭击的周明月，和岩本博士向下撤离，他们的周围也都是大楼内的后勤人员，此时大家脸上都充满了惊慌。
“大家别怕，奥特曼会来救我们的，他一定会打败那个家伙！”
鹿野看着慌张的大家，开口安慰道。
“啊，那是......”本来头脑昏沉的周明月，突然向窗外一看，只见视线之内是一个看不见大小的火球，正迅速接近这座总部大楼。
“啊！”
看见这一幕的人们，都吓得抱头趴在了地上。
“嗯？”
等了许久，见周围好像都安然无恙，周明月抬头看了一眼，顿时忍不住瞪大了双眼。
“是奥特曼，是奥特曼救了我们！”
只见窗外，一个红银相间的背影正挡在火球面前，吃力地抵挡火球的冲击力。
“哈！”
奥特曼一声怒吼，手上的能量屏障向前方推去，硕大的火球原路不动的向着杰顿飞去。
一道巨大的蘑菇云飞起，待烟雾散尽之后，只见杰顿完好无损的站在原地，位于头部的黄色能量发光体，还是在一闪一闪的发出奇特的声响。
看着还是正在走向本部大楼的杰顿，奥特曼飞向空中，不断旋转施展定身光线。
却没想到这招对杰顿完全没用，反而被杰顿发射小火球打断。
从地上爬起的奥特曼重新开始和杰顿战斗，但是杰顿却突然瞬移到奥特曼的身后，在其身后发动攻击。
面对杰顿不断地瞬移，以及能防御光线技能的屏障，奥特曼首次在战斗中落入了下风。
奥特曼的红灯开始闪烁。
原作中奥特曼的设定上吸收一次太阳能，只能在蓝星上活动三分钟，这个设定怎么说呢，后期你看有哪个奥特曼遵守过。
所以这条很蠢的设定，赵城也将其改成了后期新奥特曼的设定，本体的奥特曼是很强大的，但是由于为了维持田进的生命，所以奥特曼的存在时间只能由奥特曼的人间体的身体素质来决定，人间体的体质越强，奥特曼能发挥出的力量就越强大。
不过第一部奥特曼并不知道人类和奥特曼的羁绊可以爆发出强大的力量，整部剧都是奥特曼在操控田进的身体，田进的意识则是陷入沉睡，在后面奥特曼不断来蓝星战斗后，发现奥特曼和人类融合后，可以爆发出远超自身的强大力量，所以后面的奥特曼渐渐的开始选择一心同体，而不是强制操控人类的身体。