山谷中，气氛剑拔弩张，黑衣组织成员如潮水般向柯南等人涌来。柯南迅速观察周围形势，试图在绝境中寻得一线生机。他发现山谷一侧有一条狭窄的沟壑，或许可以利用那里的地形优势进行抵抗。
“大家往那边的沟壑撤，利用地形跟他们周旋！”柯南大喊一声，率先朝着沟壑方向冲去。毛利小五郎、灰原哀和山本一郎紧跟其后。黑衣组织成员见状，加快脚步追赶，同时纷纷掏出武器，枪声在山谷中回荡。
柯南等人刚躲进沟壑，子弹便如雨点般射来，打在周围的岩石上溅起火花。“这样下去不是办法，我们得主动出击，寻找机会破坏仪式场地。”柯南一边躲避子弹，一边思考对策。
毛利小五郎从地上捡起一块石头，朝着沟壑上方的黑衣组织成员扔去，趁对方躲避之际，柯南看准时机，用麻醉枪射中了一名敌人。然而，黑衣组织人数众多，他们的攻击愈发猛烈，柯南等人被压制得难以抬头。
“柯南，这样下去我们会被困死在这里的！”灰原哀焦急地说道。就在这时，元太、光彦和步美突然出现在山谷入口。原来，他们得知柯南等人前往红叶村后，放心不下，便偷偷跟了过来。
“柯南哥哥，我们来帮你们啦！”元太挥舞着一根粗壮的树枝，朝着黑衣组织成员冲去。光彦则利用手中的弹弓，向敌人发射小石子，干扰他们的视线。步美则在一旁大声呼喊，试图分散敌人的注意力。
黑衣组织成员没想到会有援军突然出现，一时阵脚大乱。柯南等人趁机从沟壑中冲出，与少年侦探团会合。“孩子们，这里危险，你们不该来的！”毛利小五郎喊道。
“叔叔，我们不怕，我们要一起打败坏人！”步美坚定地说道。柯南心中感动，但此时并非感慨之时，他迅速指挥众人展开反击。“元太，你和叔叔负责正面吸引敌人注意力；光彦、步美，你们利用灵活的身手在周围骚扰敌人，制造混乱；灰原，你和我一起寻找仪式装置的核心，争取尽快破坏它。”
众人领命，立刻行动起来。元太与毛利小五郎配合默契，元太凭借强壮的身体，将冲在前面的黑衣组织成员撞开，毛利小五郎则施展柔道绝技，将敌人摔倒在地。光彦和步美在敌人周围灵活穿梭，时不时用弹弓和呼喊声干扰敌人，让他们无法集中精力攻击柯南和灰原哀。
柯南和灰原哀则趁着混乱，朝着仪式石台靠近。然而，黑衣组织很快发现了他们的意图，分出一部分成员前来阻拦。“不能让他们靠近石台！”白大褂男人怒吼道。
一群黑衣组织成员手持利刃，朝着柯南和灰原哀扑来。柯南毫不畏惧，他利用身边的石块和树枝，与敌人展开搏斗。灰原哀则从腰间掏出一把特制手枪，向敌人射击。手枪发射出的特殊子弹能释放出一种强烈的电磁干扰，使敌人手中的电子设备失灵。
在激烈的战斗中，柯南发现了一个身着特殊服饰的黑衣组织成员，他似乎在指挥着其他成员的行动。柯南猜测此人可能知道仪式装置核心的位置，于是他瞅准一个机会，摆脱眼前的敌人，朝着那名指挥者冲去。
指挥者见柯南朝自己冲来，露出一丝冷笑，他从怀中掏出一把匕首，准备迎战。柯南灵活地躲避着对方的攻击，同时寻找反击的机会。就在指挥者再次挥出匕首时，柯南侧身一闪，然后迅速出脚，将指挥者手中的匕首踢飞。
“说，仪式装置的核心在哪里？”柯南将指挥者按倒在地，大声问道。指挥者却紧闭双唇，一脸决绝。就在这时，灰原哀赶了过来，她拿出一个小型电击器，在指挥者眼前晃了晃。
“你最好说实话，不然有你好受的。”灰原哀冷冷地说道。指挥者犹豫了一下，最终还是屈服了，他指了指石台上的一个圆形凹槽：“就是那里，只要破坏掉里面的能量水晶，整个仪式装置就会瘫痪。”
柯南和灰原哀对视一眼，立刻朝着圆形凹槽跑去。然而，此时白大褂男人发现了他们的举动，他亲自带领一群精锐成员，朝着柯南和灰原哀追来。“你们别想得逞！”白大褂男人咆哮着。
就在柯南和灰原哀快要接近圆形凹槽时，敌人已经追了上来。“灰原，你去破坏能量水晶，我来挡住他们！”柯南说着，转身面对追来的黑衣组织成员。他捡起一块较大的石头，朝着敌人扔去，暂时阻挡了敌人的脚步。
灰原哀迅速来到圆形凹槽前，只见凹槽内镶嵌着一块散发着幽蓝色光芒的水晶，这就是能量水晶。她拿出一个小型炸弹，安装在水晶旁边，设置好引爆时间。
“柯南，搞定了，我们快走！”灰原哀喊道。柯南立刻与灰原哀一起朝着山谷外跑去。就在他们刚刚跑出一段距离时，炸弹爆炸了。一声巨响过后，仪式石台被炸得粉碎，周围的装置也纷纷失灵。
“不！”白大褂男人看着被毁的仪式场地，愤怒地咆哮着。失去了仪式场地的支持，黑衣组织在红叶村开启通道的计划宣告破产。但白大褂男人并不打算就此罢休，他下令黑衣组织成员继续追击柯南等人。
就在柯南等人陷入危机之时，远处突然传来一阵警笛声。原来是国际刑警组织在收到阿笠博士的通报后，迅速行动，找到了红叶村附近的这个仪式场地，并及时赶来支援。
看到国际刑警的到来，黑衣组织成员顿时乱了阵脚。在国际刑警的猛烈攻击下，黑衣组织成员纷纷投降或逃窜。白大褂男人见势不妙，趁着混乱，偷偷登上直升机逃离了现场。
“呼，总算是暂时安全了。”柯南看着逐渐远去的直升机，松了一口气。但他知道，黑衣组织肯定还会有其他动作，距离下个月的月圆之夜越来越近，他们必须加快脚步，阻止黑衣组织在其他地方开启仪式。
国际刑警组织的负责人走到柯南等人面前，对他们表示感谢：“多亏了你们及时发现并破坏了这个仪式场地，为我们争取了宝贵的时间。接下来，我们会加大力度在全球范围内排查黑衣组织的其他仪式场地。”
柯南点了点头：“我们也不能松懈，必须继续寻找线索，争取彻底粉碎黑衣组织的阴谋。”众人深知，这场与黑衣组织的较量还远未结束，更艰难的挑战还在后面。而他们能否在月圆之夜来临前，找到并阻止黑衣组织的所有仪式？又将如何应对黑衣组织更加疯狂的反扑？一切都充满了未知，但柯南和他的伙伴们已经下定决心，无论前方有多少艰难险阻，都要守护世界的和平，与黑衣组织战斗到底......