熵垣回廊事件平息后的第七个星周，银河联邦的量子通讯网络突然出现集体宕机。所有接收端都播放着同一段画面：漆黑的虚空中，无数透明骸骨如钟乳石般垂落，每具骸骨的胸腔里都封印着一颗正在熄灭的星辰。画面下方，一行用古灵能文篆刻的警告若隐若现——“溯时者的低语，将撕开因果的痂。”
琳恩在解析这段异常数据时，实验室的量子计算机阵列突然集体重启，屏幕上浮现出与灵墟寄生体同源的幽蓝雾气。但这次的雾气中裹挟着无数记忆残片，其中最清晰的画面是一位身披银色长袍的存在，正在用星尘编织锁链，将某种不可名状的存在封印在时空裂隙中。“这些记忆碎片...它们不属于任何已知文明的数据库。”琳恩的声音带着颤抖，全息投影中的数据开始自主排列，组成一个不断旋转的六芒星阵。
与此同时，启源星的守护者纪念碑再度发出嗡鸣，地面渗出黑色黏液，与灵枢座的珍珠色光芒产生剧烈排斥反应。洛岚的记忆棱镜表面浮现出血色纹路，当他试图读取这些纹路时，一股强大的意识洪流涌入脑海：在某个被遗忘的纪元，宇宙曾爆发过一场“灵骸战争”，战败的灵能生命体被剥离意识，骸骨成为囚禁混沌的容器。
“灵枢座和熵锚的能量波动，唤醒了沉睡的灵骸。”灵墟守望者的残响突然在众人意识中响起，这次的声音充满悔恨，“我们当年用生命铸造的封印，正在被溯时者的力量侵蚀。”话音未落，银河边缘的三十七个星系同时爆发灵能倒灌现象，恒星开始逆向燃烧，行星表面浮现出古老的献祭纹路。
薇尔的灵能共鸣场出现异常波动，她的瞳孔中浮现出无数细小的骸骨虚影。“我能听见...那些被囚禁的灵魂在呼唤。”她的指尖渗出幽蓝血液，在空中凝结成通往未知维度的符文，“它们说，只要释放灵骸，就能终结所有文明的轮回宿命。”影月立刻启动熵能抑制器，却发现薇尔的能量场已经与灵骸产生共振，任何外力干涉都会加速封印的崩解。
阿修在扫描中发现，灵骸封印的时空裂隙竟与银河联邦的星门网络产生量子纠缠。“如果裂隙完全打开，所有星门将成为灵骸入侵的通道！”他紧急启动星门自毁程序，却遭到某种未知力量的反向入侵，星门系统开始播放倒计时——当数字归零，所有星门将自动连接至灵骸维度。
洛岚带领小队前往被灵骸能量侵蚀最严重的贝塔星系。抵达时，整个星系的行星都被黑色骸骨包裹，恒星表面漂浮着巨大的颅骨状结构，其内部闪烁着与灵墟之核相似的光芒。瑟拉释放暗物质触须探测，反馈的数据显示这些骸骨正在吸收恒星的生命能量，将其转化为某种能够改写现实的“熵寂燃料”。
在探索过程中，艾琉的宇宙弦突然产生自主意识，缠绕在她的手臂上形成古老的护腕。“这是...灵骸战争时期的兵器共鸣。”艾琉的眼神变得空灵，仿佛被远古战士附身，“这些弦丝曾斩杀过试图吞噬宇宙的混沌，现在它们渴望再次饮血。”
随着灵骸能量不断增强，时空开始出现扭曲。小队成员接连遭遇“时间残影”——他们看到了平行时空中自己的不同结局：洛岚的棱镜被灵骸腐蚀，成为毁灭文明的武器；薇尔化作灵骸之主，带领骸骨军团吞噬星系；影月的熵能暴走，将整个宇宙拖入永恒的死寂。
“这些残影是警告，也是机遇。”琳恩在量子波动中捕捉到特殊频率，“我们必须找到封印灵骸的‘镇魂歌’，那是由初代灵墟守望者的生命精华谱成的旋律。”阿修通过解析星门残留数据，定位到镇魂歌的波动来自银河系中心的“星骸圣殿”。
当小队抵达圣殿，却发现这里早已被灵骸占据。中央祭坛上，一具巨大的骸骨正在吸收所有灵骸的能量，其胸腔中的星辰即将熄灭。薇尔突然挣脱控制，飞向骸骨，她的灵能场与骸骨产生共鸣，释放出足以撕裂空间的能量。
洛岚当机立断，将记忆棱镜与艾琉的宇宙弦、瑟拉的暗物质力量融合，构建出能够干扰灵骸共鸣的“意识屏障”。影月则利用熵能波动，在圣殿中制造出局部时间循环，延缓灵骸的能量吸收进程。琳恩在废墟中找到了记载镇魂歌的灵能石碑，其表面的符文正在随着灵骸的苏醒而消散。
在时间循环即将崩溃的瞬间，薇尔在意识深处与灵骸意识展开对决。她将自己的记忆化作利刃，斩断了灵骸对她的控制。与此同时，琳恩成功激活镇魂歌，悠扬的旋律化作金色锁链，缠绕在巨大骸骨身上。洛岚带领众人将各自的力量注入锁链，最终将灵骸重新封印。
战斗结束后，星骸圣殿化作尘埃，只留下一颗散发着微弱光芒的种子。这颗种子落入贝塔星系，逐渐生长成连接不同维度的“灵骸树”，其果实成为记录宇宙历史的新载体。而薇尔体内残留的灵骸共鸣，让她拥有了感知平行时空的能力，这股力量既是祝福，也是随时可能爆发的危机。记忆棱镜上的纹路再次变化，预示着新的未知正在宇宙深处悄然酝酿。